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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全dna组低淬硬层重测序(Low coverage WGS,LcWGS)指的是运用较低淬硬层(~1×)的重测序数值完成染色体变种临床诊断,时候利用dna型注射,将低溶解度数值注射为高溶解度dna型数值。LcWGS 免体统发掘,测序损坏后可及时更换低,是可以修改全dna组染色体变种,更有效于大面积样品的遗传性状位置及 GS 选育应用软件。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可获得了全基因组组的基因遗传规律突变
  • 高性价比
    以非常低的测序生产费用少,有高容重的符号,测量率高
  • 大群体
    样本检测
    应应用于大消费群的基因组型检侧及调查
  • 分型
    准确性高
    研究背景充填计算方法,临床表现明确率电动车续航98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS遗传性状定位系统及GS没想到相对
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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