产品介绍
由国水产品科学的深入分析院微生物技木深入分析心中李炯棠深入分析单位连合与郑州康普森农林业科技高新产业不多单位设计一款最适合于鲤生物育种、款式认定等多使适用范围的基因组生物育种单片机集成电路芯片
——“鲤育壹号”(图2)。该单片机集成电路芯片包函了20K个高品的质量的SNP位点,为桂鱼高新产业提质提产,生物育种良好、稳产、耐粗、高抗、耐密等市场大的特性的桂鱼种苗具备强有力的的技木作为支撑点。
“鲤育六号”适用康普森CAGT(®)靶点采集测序能力,内含16种主养鲫鱼的全表观遗传组重测序遗传变异和非常关键性经济条件遗传物理性质关联关系标注。“鲤育六号”集成ic位点包裹全表观遗传组选购繁育负效应大的位点和内容涵盖多种多样鲫鱼群多态性标注。该集成ic内含鲫鱼营养摄入高质量遗传物理性质(粗蛋白酶、粗脂肪堆积细胞、核苷酸、脂肪堆积细胞酸、胸肌质构、肌间刺、纹段等)、血样组成成分及含锌量、性別等遗传物理性质的分子式标注18056个,虽然还是指判断16种鲤蔬菜种类特喜欢的人位点144个,常用于非常关键性遗传物理性质的繁育值想大概和蔬菜种类确权庇护。顺利通过样品集成ic测试英文,“鲤育六号”集成ic,食品位点排除率高,均值排除率起到了95.18%,食品增强性好、表观遗传型合理高,多次重复样品均值分析一样比率98.77%,食品能优秀。
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成品产品参数
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关健技术指标
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“鲤育壹号”生物育种存储芯片
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标志消息
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标识形式
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SNP
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标出数目
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20359
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鲤鱼营养品质性状、血液成分及含量、 性别等性状功能位点
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18056
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明细鉴别位点
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144
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技术设备类
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康普森CAGT®靶点抓取测序枝术
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选取人类基因组
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GCF_018340385.1
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数据表现
“鲤育一号”— 染色体分布情况
鲤鱼(Cyprinus carpio)作为异源四倍体鱼类,各由25条染色体组成。该芯片囊括了A亚基因组和B亚基因组的鲤亚基因组水平的变异,为在四倍体背景下开展重要经济性状遗传解析,进行基因组选择育种技术创新提供了新的视野。
图1 芯片位点在染色体上(A基因组和B基因组)的分布图
“鲤育一号”育种芯片 — MAF分布
图2 芯片位点MAF分布
“鲤育一号”育种芯片 — 位点注释情况
图3 芯片位点注释情况
“鲤育一号”育种芯片 — 分型一致性
图4 重复样本分型一致性
通过对3组重复样本进行分型,显示平均一致率达98.77%。
以上结果表明,鲤育一号位点选择合理、变异丰富、一芯多用(育种、品种鉴定、功能位点因果检测),芯片设计出众,分型结果表现优异,能够满足大量样本的检测需求。